Hallo Stefan,
vieleicht kannst Du den Motor mit einem Zahnriemen (GT2 für 3D-Drucker) entkoppeln. Bei einem etwas längeren Riemen und zwei gleichen (?) Zahnrädern, könnte auch das herausdrehen der Mikrometerschraube ausgeglichen werden. Den Motor auf einer eigenen Grundplatte mit Sorbothane Pads aufkleben und mit einem Gummiband abspannen. Die Verbindung Zahnrad zur Mikrometerschraube könnte schwierig werden. Vieleicht kannst Du in das Rohr, das Du benutzt drei oder sechs Gewinde für Stellschrauben schneiden, wie bei den Okularadaptern für Teleskope (z.B. eBay 390641269803) und das aufgeklebte Zahnrad damit zentrieren. Problematisch wäre noch die einseitige Belastung der Mikrometerschraube die Du mit einem Lagerbock (eBay 162325821289) und der Wellenkupplung abfangen könntest.
Grüße Josef